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xuyaozhong
父系单倍群O
为何23andme上显示的结果与wegene绑定并分析23andme数据不一致?
23andme上父系显示为O3a3c1*,wegene绑定数据分析为O3a2c?
这是什么原因?
2015-10-30 • IP属地中国
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wang
-
哈佛医学院、德国马普所分子人类学博士后
很简单,O3a3c1*是多年前的命名方式了,现在我们发现并在genotyping中使用了更多更细的东亚位点,东亚的O系已经采用新的命名方式了,也就是之前的O3a3是现在的O3a2了。Y的命名中O3a...等是会不断变化,重要的还是看SNP位点(比如:M134, M117, 002611等),所以最清楚的命名方式是“名称-SNP”,譬如:O3a2c1a-M117。
费力科思
-
WeGene勤杂工
两种可能:
1、23andme使用的ISOGG的版本是比较旧的,WeGene因为是新开发的,所以使用的是最新版的ISGOO的Y Hapogroup标准;
2、分析方式差异。Y单倍群的定义虽然有ISOGG的标准,但因为23andme所测的Y染色体上的位点数比较少,只有3000多个,所以无法完全根据ISOGG的标准来严格判断,还需要通过一些概率或者机器学习的方法推测。这些方法的大体逻辑都是一样的,但实现细节的差异会导致结果的细微差异。
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xuyaozhong
父系单倍群O
696 个讨论
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赞同来自: 费力科思 、BioStar 、magix
1、23andme使用的ISOGG的版本是比较旧的,WeGene因为是新开发的,所以使用的是最新版的ISGOO的Y Hapogroup标准;
2、分析方式差异。Y单倍群的定义虽然有ISOGG的标准,但因为23andme所测的Y染色体上的位点数比较少,只有3000多个,所以无法完全根据ISOGG的标准来严格判断,还需要通过一些概率或者机器学习的方法推测。这些方法的大体逻辑都是一样的,但实现细节的差异会导致结果的细微差异。
赞同来自: zhengqiang
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